Am Stammsitz des Unternehmens in Mainz entstand von Mai 2009 bis zum Herbst 2010 eine neue Hauptverwaltung. Energetisch ist das Gebäude so ausgelegt, dass es mittels Windkraft, Photovoltaik und Geothermie mehr Energie erzeugt, als es für den laufenden Betrieb benötigt.
Der ökologisch vorbildliche Neubau (Energieplus-Gebäude) ist ein Bekenntnis zur rheinland-pfälzischen Landeshauptstadt und zu Deutschland. Für die vorbildliche Umsetzung des Nachhaltigkeitsgedankens beim Bau seiner neuen Hauptverwaltung erhielt Werner & Mertz im Juni 2010 den anerkannten rheinland-pfälzischen Umweltpreis in der Kategorie "Wirtschaft" und wurde 2012 als bisher einzige Industrieverwaltung Deutschlands mit der höchsten internationalen Nachhaltigkeitszertifizierung "LEED Platinum" ausgezeichnet.
